بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA

بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA

تخفیف ویژه به مدت محدود فقط تا فردا پنج‌شنبه 30 بهمن


خرید

پشتیبانی: 09374433704


هدف از این پایان نامه بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA می باشد

دانلود پایان نامه رشته کشاورزی

بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA

 
 
 
چکیده:
ثبت و شناسایی ارقام و پایه های گیاهی و تعیین رابطه ژنتیکی بین آنها مستلزم دسترسی به روشهای دقیق و قابل تکراری که از شرایط محیطی متأثر نباشد، می باشد. روشهای سنتی تعیین هویت بر اساس مشاهده ظاهری درخت و میوه است.  با توجه به اینکه بسیاری از خصوصیات ظاهری تحت تأثیر عوامل محیطی قرار می گیرند، این روش قابل اعتماد نیست.با استفاده از نشانگرها در سطح ملکول DNA می توان اطلاعات دقیقی از ژنوم گیاهان بدست آورد.از جمله نشانگرهای معتبر در بررسی ژنوم سیب، نشانگر SSR است که بدلیل تکرارپذیری بالا، ایجاد الگوی باندی نسبتاً ساده و توارث همبارز در بررسی تنوع ژنتیکی و شناسه دار کردن ارقام و  پایه های سیب کارایی بالایی دارد.
 
در بررسی حاضر از 5 جفت نشانگر پلی مورفیک SSR بر روی 24 رقم و پایه سیب بمنظور تهیه شناسنامه ژنتیکی برای بعضی از ارقام و پایه ها و همچنین تعیین رابطه ژنتیکی بین آنها استفاده شد. نمونه های برگی از کلکسیون سیب جمع آوری و DNA آنها استخراج شدند و سپس با استفاده از نشانگرهای اختصاصی SSR مورد تکثیر قرار گرفتند.  پس از الکتروفورز عمودی در دستگاه توالی یاب  DNA در ژل پلی آکریل آمید و رنگ آمیزی نیترات نقره در مجموع 52 آلل پلی مورفیک در 5 لوکوس ریزماهوار ( میانگین 4/10 در هر لوکوس) شناسایی شدند.
تجزیه کلاستر بطور جداگانه برای ارقام و پایه ها بر اساس حضور و عدم حضور باند با استفاده از برنامه NTSYS و ضریب تشابه Dice  مبتنی بر UPGMA انجام گرفت.  دندوگرام حاصل از ارقام نشان داد که ارقام مورد بررسی تنوع زیادی داشتند و در 6 کلاستر جای گرفتند و سیبهای گلاب مورد بررسی توسط این 5 جفت نشانگر از هم تفکیک شدند.  در دندوگرام پایه ها شباهت دو پایه MM111و  MM106 مشاهده گردید.با استفاده از 3 آغازگر (CH01H01,02B1,CH02B10) باندهای اختصاصی در ارقام (24 رقم) مشاهده شد. همچنین اگوی نواربندی اختصاصی برای بعضی از ارقام در هر آغازگر بدست آمد.  در نهایت این 5 آغازگر توانستند آللهای اختصاصی مربوط به پایه ها را تعیین کنند.
 
 
 
 
کلمات کلیدی:

مارکر SSR

شناسایی مولکولی

ارقام و پایه های سیب

 
 
 
 
 
مقدمه   
مهمترین درختان میوه ای که در مناطق معتدله و سردسیری به صورت اهلی درآمده‌اند در خانواده گلسرخیان  قرار دارند مانند سیب، گلابی، آلوچه، گیلاس و..... .  سیب از نظر اقتصادی بیشترین اهمیت را در بین محصولات درختی مناطق معتدله و سردسیری دارد و تعداد زیادی از ارقام تجاری آن به دلیل گرده‌افشانی باز، تلاقی‌های كنترل شده و یا تلقیح موتاسیون سوماتیكی با ارقام سازگار، قابل استفاده در برنامه‌های اصلاحی اند. یك مشكل قابل توجه در صنعت سیب و فراورده های آن تعیین هویت ارقام آن می‌باشد. روشهای سنتی تعیین هویت بر اساس مشاهده ظاهری درخت ومیوه است. با توجه به اینكه بسیاری از خصوصیات ظاهری تحت تأثیر عوامل محیطی قرار  می گیرند، این روش، قابل اعتماد نیست. روش دیگر برای تعیین هویت ارقام استفاده از نشانگر می باشد. استفاده از نشانگرها در سطح مولكول DNA  دقیق ترین روش بررسی است که جزئیات بیشتری از ژنوم ارقام سیب را ارائه می‌دهد. ازجمله نشانگرهای معتبردر بررسی ژنوم سیب، نشانگر  SSRاست که به دلیل قابلیت تکرارپذیری بالا، ایجاد الگوی باندی نسبتاً ساده و توارث هم بارز، در بررسی تنوع ژنتیکی و شناسه دار کردن ارقام سیب کارایی بالایی دارد. در این تحقیق با استفاده از نشانگرهای منتخب SSR تنوع ژنتیکی 29 رقم و پایه سیب و امکان دستیابی به نوارهای اختصاصی DNA در هر یک از ارقام و پایه ها مورد بررسی قرار گرفت.
 
 
 
 
فهرست مطالب
چکیده: 1
مقدمه 2
 
فصل اول:بررسی منابع و کلیات 3
1-1- تاریخچه و گسترش سیب در جهان 4
2-1- درخت سیب و خواص بتانیكی آن 5
3-1- فرآورده‌های سیب 6
4-1- خواص دارویی سیب 6
5-1- ارزش غذایی سیب 7
6-1- پایه‌های سیب 8
1-6-1-پایه‌های بذری 8
2-6-1- پایه‌های رویشی(غیر بذری) 9
1-2-6-1-پایه‌های مالینگ 9
2-2-6-1- پایه های مالینگ مرتون 10
3-2-6-1-پایه های بوداگوسکی 11
7-1- زیست شناسی مولكولی 11
1-7-1- نشانگر 11
2-7-1- هدف از كاربرد نشانگر 11
3-7-1- انواع نشانگرهای ژنتیكی 12
1-3-7-1- نشانگرهای ریخت‌شناسی (مورفولوژیكی) 12
2-3-7-1- نشانگرهای سیتوژنتیكی 12
3-3-7-1- نشانگرهای ملکولی در سطح پروتئین 12
4-3-7-1- نشانگرهای مولكولی در سطح  DNA 13
5-3-7-1- انواع نشانگرهای DNA 14
الف) نشانگرهای DNA غیر مبتنی بر PCR
- تفاوت طول قطعات حاصل از هضم (RFLP)  14
-  تعداد متفاوت ردیف‌های تكراری و ماهوارك‌ها (VNTR   & Minisatellites)  15
-  پویش ژنومی نشانه‌های هضم (RLGS)  15
ب) نشانگرهای DNA مبتنی بر PCR 15
4-7-1- ردیف‌های تكراری 17
1-4-7-1- ماهواره‌ها 18
2-4-7-1- ماهوارك‌ها 18
3-4-7-1- ریز ماهواره‌ها (میكروستلایت‌ها یا SSR) 19
5-7-1- چگونگی ایجاد میكروستلایت‌ها 20
6-7-1- خصوصیات نشانگرهای SSR 20
7-7-1- كاربردهای نشانگرهای SSR 21
8-7-1- مزایای ریز ماهواره ها 21
9-7-1- معایب ریز ماهواره‌ها 22
10-7-1- اساس چند شكلی در جایگاههای ریزماهواره 23
1-10-7-1-  مدل کراسینگ اور نا متقارن (UCO)  23
2-10-7-1- مدل سر خوردن پلیمراز هنگام همانند سازی(SSM) 24
8-1- واكنش زنجیره ای پلیمراز 24
1-8-1- اجزای واکنش PCR 24
1-1-8-1- آنزیم 24
2-1-8-1-مخلوط ذروكسی نوكلئوتید تری فسفات ( dNTPs ) 25
3-1-8-1-  DNA الگو 25
4-1-8-1-  آغازگرها 25
5-1-8-1- بافرها و كلرید منیزیوم 26
2-8-1- عوامل مؤثر براختصاصی بودن واكنش PCR 26
1-2-8-1- غلظت مخلوط  PCR 26
2-2-8-1- دما 27
3-2-8-1- تعداد و طول سیكل 27
4-2-8-1- افزاینده های PCR 27
3-8-1- (TD-PCR) Touch Down PCR 27
4-8-1- PCR  آشیانه ای 28
9-1- الكتروفورز ژل آگارز 28
10-1- الكترفورز ژل پلی آكریل آمید 29
11-1- مروری بر تحقیقات انجام شده توسط نشانگر SSR 29
 
فصل دوم مواد و روشها 31
1-2- مواد گیاهی 32
2-2- استخراج DNA 36
1-2-2- استخراجDNA به روش دلاپورتا 36
2-2-2- استخراج DNA به روش  CTAB 37
3-2- تعیین کیفیت نمونه های DNA 38
4-2- تعیین کمیت نمونه های DNA 39
5-2- PCR 39
1-5-2- اجزای واکنش  زنجیره‌ای پلیمراز 39
1-1-5-2- آغازگرها 39
2-1-5-2- آنزیم Taq DNA polymerase 40
3-1-5-2- بافر PCR 41
4-1-5-2- کلرید منیزیوم 41
5-1-5-2- dNTP 41
2-5-2- بهینه سازی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز 42
6-2- الكتروفورز فراورده های PCR 43
1-6-2- الكتروفورز افقی در ژل آگارز 43
2-6-2- الكتروفورز عمودی در ژل پلی آکریل آمید 43
1-2-6-2- تیمار شیشه‌ها 44
2-2-6-2- تزریق ژل 44
3-2-6-2- گرم نمودن ژل 45
4-2-6-2- واسرشته سازی محصولات PCR 45
3-6-2 رنگ آمیزی ژل 46
7-2- تجزیه و تحلیل داده ها 47
1-7-2- امتیازدهی باندها 47
2-7-2- تجزیه خوشه ای 48
3-7-2-تعیین اندازه باندها و الگوی نواربندی اختصاصی 48
 
فصل سوم نتیجه گیری و بحث 49
1-3- نتایج استخراج DNA 50
2-3- بهینه سازی دمای اتصال آغازگرها 52
3-3- بهینه سازی روش PCR 52
4-3- بررسی نهایی نتایج حاصل از PCR 52
5-3- بررسی چند شکلی های SSR 54
6-3- بررسی و تحلیل روابط خویشاوندی بین ارقام 57
7-3- تعیین شناسنامه ژنتیکی برای ارقام 60
7-3- تعیین شناسنامه ژنتیکی برای ارقام 61
1-7-3- تعیین آللهای اختصاصی 61
2-7-3- الگوی نواربندی اختصاصی در ارقام 61
8-3- بررسی میزان خویشاوندی بین پایه ها 64
9-3- تعیین شناسنامه ژنتیکی برای پایه ها 65
1-9-3- تعیین آللهای اختصاصی 65
 
فصل چهارم:نتیجه گیری کلی و پیشنهادات 75
نتیجه گیری کلی 80
پیشنهادات 84
ضمائم 87
منابع و مآخذ: 90
 
 

سوالات احتمالی شما درباره بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA

چطور میتونم فایل بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA رو دریافت کنم؟

برای خرید و دانلود این فایل میتونید دکمه سبز رنگ خرید و دانلود فوری کلیک کنید و بلافاصله بعد از پرداخت، لینک دانلود بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA براتون نمایش داده میشه و میتونید فایل رو دانلود کنید.

این فایل چطوری به دست من میرسه؟

بعد از خرید به صورت اتوماتیک، لینک دانلود فایل بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA برای شما نمایش داده میشه و میتونید دانلود و استفاده کنید.

قیمت بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA چقدر هست؟

در حال حاضر قیمت این فایل با تخفیف ویژه 57 هزار تومان هست.

چطور میتونم با پشتیبانی سایت در ارتباط باشم؟

از طریق شماره 09374433704 میتونید با پشتیبانی سایت در ارتباط باشید.

برچسب ها:



ارﻗﺎم ﺳﯿﺐ ﺑﺎ اﺳﺘﻔﺎده از ﻣﺎرﮐﺮﻫﺎ در ﺳﻄﺢ ﻣﻮﻟﮑﻮل DNA اﻋﺘﻤﺎد ﺑﻪ ﻧﻔﺲ داﺷﺘﻪ ﺑﺎﺷﯿﻢ ﺧﺮﯾﺪ و داﻧﻠﻮد. ژﻧﻮم ارﻗﺎم ﺳﯿﺐ. رواﺑﻂ ژﻧﺘﯿﮑﯽ ارﻗﺎم و ﭘﺎﯾﻪ ﻫﺎی ﺳﯿﺐ. ﺑﺮرﺳﯽ ﺗﻨﻮع 

با استفاده از نشانگرها در سطح ملکول DNA می توان اطلاعات دقیقی از ژنوم گیاهان بدست آورد.از جمله نشانگرهای معتبر در بررسی ژنوم سیب، نشانگر SSR است که بدلیل 

ﺳﻴﺐ ﺯﻣﻴﻨ. ﯽ. ﺍﻳﺮﺍﻥ. ﺑﺎ ﺍﺳﺘﻔﺎﺩﻩ ﺍﺯ. ﺗﮑﻨﻴﮏ. RAPD-PCR. ﻏﻼﻣﺮﺿﺎ ﺻﺎﻟﺤﯽ ﺟﻮﺯﺍﻧﯽ DNA. ﺩﺭ. ٢٨. ﺭﻗﻢ ﺳﻴﺐ ﺯﻣﻴﻨﯽ ﺍﻳﺮﺍﻥ ﻏﺪﻩ ﻫﺎ. ﯼ. ﺍﺭﻗﺎﻡ ﺩﺭ ﮔﻠﺨﺎﻧﻪ ﻛﺸﺖ ﻭ ﺩﺭ.

شناسایی و بررسی انزیم کاتالاز سنتاز در ژنوم چند گونه گیاهی بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپهای گندم دوروم با استفاده از مارکر مولکولی ISSR.

by جهرمی شیرازی · 2010 — با استفاده از این نشانگرها، 12 آلل اختصاصی واضح و تکرار پذیر در 5 پایه مورد بررسی، شناسایی شد. نتایج، بیانگر کارایی بالای نشانگر ریزماهواره در شناسایی ارقام 

نمایش #عنواننویسنده22شمارش ساختارهاي شبه گره rnaمحقق,محمد رضا64ريزپوشاني عصاره برگ زيتونحاجي تبار,محمد جواد160انتقال ژن به توتونرعنائيان,ناهيدView 907 more rows

تنوع ژنتیکی ارقام و ژنوتیپ‌های پسته از نظر مقاومت به بیماری پوسیدگی طوقه بررسی تنوع مولکولی در لاین های اصلاحی گندم دوروم با استفاده از نشانگرهای SCoT.

by خدادوست · 2017 — جنگل هیرکانی ایران با استفاده از نشانگر ISSR-PCR Goulão و همکاران در سال 2001 میزان تشابه 41 رقم تجاری سیب با استفاده از مارکرهای SSR وISSR ارزیابی شد.

)و پروتئین RNA ،DNA) مورد استفاده در محیط های کشت مرحله ی اول کاهش یافت. بررسی گیاهان تراریخت در سه سطح. بهینه سازی ارگانوژنز نابجا در گیاه سیب زمینی )ارقام 

by محسنی آذر · 2012 — سیب. گ. می. الماسی. يكی از ارقام پاكوتاه سیب است كه انتقال ژن با استفاده از آگروباكتريوم يكی از روش رديابی ژن انتقالی در ژنوم گیاهان تراريخته.

در ﺟﻬﺖ اﺻﻼح و ﻣﻌﺮﻓﯽ ارﻗﺎم ﺑﺎ ﮐﯿﻔﯿﺖ ﺑﺎﻻ ﻧﯿﺎزﻣﻨﺪ ﺷﻨﺎﺧ اﺳﺘﻔﺎده از ﻧﺸﺎﻧﮕﺮﻫﺎي ﻣﻮﻟﮑﻮﻟﯽ و اﺑﺪاع و DNA. ﺗﺮﮐﯿﺒﺎت ﺗﻮاﻟﯽ. ژﻧﻮم را ﺑﻪ ﺗﺼﻮﯾﺮ.

by جهانگیرزاده خیاوی · 2013 — ﻫﺎ ﻭ ﺍﺭﻗﺎﻡ ﮔﻮﻧﺎﮔﻮﻥ ﺳﻴﺐ ﻣﻴﺒﺎﺷﺪ ﲠﻄﻮﺭ ﮐﻠﯽ، ﺑﺮﺭﺳﯽ ﺗﻨﻮﻉ ژﻧﺘﻴﮑﯽ ﻧﺸﺎﻥ ﺩﺍﺩ ﮐﻪ ﻣﺎﺭﮐﺮ .ﺩ ( ﺍﻣﺎ ﻧﺸﺎﻧﮕﺮﻫﺎی ﻣﻮﻟﮑﻮﻟﯽ. DNA. ﻭ. ﻓﺮﺻﺖ ﺑﺮﺭﺳﯽ ﻣﺴﺘﻘﻴﻢ )ﺁﻳﺰﻭﺯﺍﻳﻢ.

by محمدزاده · 2013 — ﻋﻨﻮان ﺷﺎﻫﺪ ﺑﺎ اﺳﺘﻔﺎده از ﺻﻔﺎت ﻣﺮﻓﻮﻟﻮژﻳﻜﻲ و ﻣﺎرﻛﺮ در ﺳﻄﺢ ﻳﻚ درﺻﺪ ﻫﻤﺒﺴﺘﮕﻲ ﺗﺠﺰﻳﻪ ﻣﻮﻟﻜﻮﻟﻲ. ﺑﺮاي ﺑﺮرﺳﻲ ﭼﻨﺪ ﺷﻜﻠﻲ. DNA. ﺑﻴﻦ ارﻗﺎم زردآﻟﻮ. ﻣﻮرد آزﻣﺎﻳﺶ.

نتيجه گيري: هر يك از اين نشانگرها سطوح مختلفي از تنوع را در سطح ژنوم بررسی تنوع ژنتیکی ارقام ناشناخته و تجاری مرکبات شمال کشور با استفاده از نشانگرSSR.

بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA · arshia. 30 بازدید 4 سال پیش. 3:08 · آموزش کار با مارکرها در افترافکت ( فیلم رایگان).

94563 |doc کشاورزی و زراعت+بررسی ژنوم ارقام سیب با استفاده از مارکرها در سطح مولكول DNA. مشخصات محصول دسته کشاورزی و زراعت حجم 5/63 کیلوبایت صفحه 94 فرمت 

بررسي تنوع ژنتيكي جمعيت‌هاي باريجه ايران‌، با استفاده از ماركرهاي مولكولي RAPD بررسي تنوع ژنتيكي در برخي از ارقام تجاري سيب زميني ايران با استفاده از 

by M Shazdehahmadi · 2014 — سطح زیر منحنی ترین روش کنترل این بیماری، ایجاد و استفاده از ارقام مقاوم می ای افزایش داده است. یک نشانگر مولکولی برای یک ژن خاص، قسمتی از. DNA.

ها به عنوان نشانگر مولکولی در بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ ترین عناصر قابل جابجایی در ژنوم یوکاریوت بررسی کیفیت. DNA. با استفاده از ژل آگارز.

لذا استفاده از نشانگرهای dna که چند شکلی را در سطح dna اشکار می کنند،می توانند بومی گندم سیستان با استفاده از نشانگر مولکولی ssr مورد بررسی قرار گرفت.